2013-2025 Director, Centro Interdisciplinario para la Investigación Acuícola (INCAR) Proyectos FONDAP-ANID 1510027, 1522A0004, 1523A0007. Investigador Principal Linea de Investigación “Sustentabilidad ambiental”.

2019-2021 Director Alterno. Proyecto “Fortalecimiento de capacidades para evaluar vulnerabilidad de la pesca del camarón rosado al Cambio Climático en zonas costeras de Uruguay”. Financiado por la Agencia Uruguaya de Cooperación Internacional (AUCI) y la Agencia Chilena de Cooperación Internacional para el Desarrollo (AGCID). (Proyecto bi-nacional Nº6/2019). 

2022-2024 Director. Proyecto “Potenciando el desarrollo sostenible de la costa de Ñuble: gestión integrada, encadenamiento productivo y conservación del patrimonio natural”. Proyecto financiado por el Fondo de Innovación para la Competitividad (FIC-R) Región de Ñuble (BIP 40035832-0).

2022-2024. Director. Proyecto “Aumento de la Competitividad de Caletas Pesqueras del Biobio”.Proyecto financiado por el  Fondo de Innovación para la Competitividad (FIC-R). Región del Biobío (BIP40040409-0).

2022-2024 Director. Proyecto Ecosystems Carrying Capacity to support salmon farming antimicrobial loads. Financiado por Monterrey Bay Aquarium (USA). Proyecto postdoctoral  realizado por la Dra. María Lorena González. Co-supervisado con la Dra. Doris Soto (INCAR) 

2015- 2025 Director, Programa de Estudios Ecosistémicos del Golfo de Arauco (PREGA), Facultad de Ciencias Naturales y Oceanográficas.

2006- 2025 Director, Programa de Investigación Marina de Excelencia (PIMEX), Facultad de Ciencias Naturales y Oceanográficas.

2022-2025 Investigador Responsable. Proyecto “Estudios ecosistémicos del estuario Laraquete: biodiversidad bentónica y planctónica, estado sanitario y dinámica de intrusión de agua de mar”. Programa de Estudios Ecosistémicos del Golfo de Arauco (PREGA), FCNO-UDEC, financiado por Celulosa Arauco y Constitución S.A. 

2019-2025 Investigador Responsable proyecto “Biodiversidad del macro y mega bentos submareal y su variación temporal en la zona adyacente a los emisarios” (Investigador Responsable: Dr. Renato Quiñones). Programa de Estudios Ecosistémicos del Golfo de Arauco (PREGA), FCNO-UDEC, financiado por Celulosa Arauco y Constitución S.A. 

2023-2025 Investigador. Proyecto: “Estudio de los susbsistemas ecológicos marinos y estuarinos del área adyacente al Complejo Horcones en el Golfo de Arauco, Región del Bio-Bio. Programa de Estudios Ecosistémicos del Golfo de Arauco (PREGA), FCNO-UDEC, financiado por Celulosa Arauco y Constitución S.A. 

2020-2025 Investigador Responsable. Proyecto “Ecología y biología del lobo marino común, Otaria flavescens, en el Santuario Islotes Lobería de Cobquecura”. Programa de Investigación Marina de Excelencia (PIMEX), FCNO-UDEC, financiado por Celulosa Arauco y Constitución S.A. 

2020-2025 Investigador Responsable. Proyecto ”Estudio Ambiental y Productivo de la Zona de Pesca Bajos de Mela (Región de Ñuble)”.  Programa de Investigación Marina de Excelencia (PIMEX), FCNO-UDEC, financiado por Celulosa Arauco y Constitución S.A. 

2022-2023. Investigador Asociado. Proyecto “Risk analysis as a tool for the prioritization of secondary environmental quality standards in the main tributary rivers to the fjord system of Northwestern Patagonia, under hydrological drought scenarios”. (Univ. Católica Santísima Concepción, UDEC, UACH, U. Talca, CIEP, U. Biobío). Proyecto financiado por el Fondo de Investigación Estratégica en Sequía, ANID. (FSEQ210030-ANID; Director del proyecto: Dr. Jorge León, UCSC & INCAR)

2020-2022 Director. Proyecto “Características de la intermediación de primera venta en la cadena de comercialización de la pesquería artesanal de merluza común”. Proyecto financiado por Oceana.

2019-2020 Investigador. Proyecto “Diseño e implementación de un programa de capacitación sobre adaptación al cambio climático en pesca y acuicultura para funcionarios públicos, expertos nacionales y tomadores de decisiones a nivel nacional, regional y comunal”. Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura; Proyecto FAO 9-2018. Ejecutado por el Centro COPAS e INCAR.

2017-2020 Profesor Patrocinante. Proyecto Post-Doctoral FONDECYT 3170529. Anticipating crises in stressed socio-ecological systems: developing fractal early-warning indicators for aquaculture and fisheries in Chile. Post-doctorante: Dr. Rodrigo Montes. Profesor Patrocinante: Renato Quiñones.

1. Montes, R., Quiñones R.A. 2025. Early detection of sea lice epidemic transitions and changes in long-term abundance levels in salmon farming areas. Aquaculture Aquaculture 603 (2025) 742385. https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2025.742385. (WoS; Q1).
2. Vásquez, C., Quiñones, R.A., Díaz, O., Rozbaczylo, N., Pérez-Schultheiss, J., Hernández‑Miranda, E. 2025. Mussel Farms Drive Species Replacement through Ecological Drift and Dispersal. Environmental and Sustainability Indicators 25, 100579 https://doi.org/10.1016/j.indic.2024.100579 (WoS; Q1).
3. Barrios-Guzmán,C., Harrod, C., Guerrero, A., Muñoz, L., Pavez, G., Quiñones, R., Reyes, H., Santos-Carvallo, M., Zárate, P.M., Newsome, S.D., Sepúlveda, M. 2024..Bottom-up processes drive isotopic variation in the South American sea lion Otaria flavescens across a 2300 km latitudinal gradient. Marine Environmental Research 202, 106732. https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2024.106732 (WoS; Q1)
4. Inostroza, P., Soriano, Y., Carmona, E., Krauss, M.K., Brack, W., Backhaus, T., Quiñones , R.A. 2024. Preliminary dataset of emerging contaminants in surface water, bottom water, porewater, and sediment: Urban and aquaculture impacts in Coliumo bay and Caucahue Channel in the central and southern coast of Chile. Data in Brief 55, 110593. https://doi.org/10.1016/j.dib.2024.110593 (WoS; Q3).
5. González, M-L., Fuentes, M.E., Molina, V., Quiñones, R.A. 2023. Effects of ethoxyquin on metabolism and composition of active marine microbial communities. Aquaculture 569,  739345.https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2023.739345  (WoS; Q1)
6. Vögler, R., Soto, D., Quiñones, R.A., Martínez, G., D’Ambrosio, L., Alaggia,S.,  Surroca, A., Pérez, F. 2023. Vulnerability assessment of the pink shrimp small-scale fishery to climate change in southwestern Atlantic brackish coastal lagoons (Uruguay). Ocean & Coastal Management 245: 106864 https://doi.org/10.1016/j.ocecoaman.2023.106864 (WoS; Q1)
7. Vásquez, C., Quiñones, R.A., Brante, A., Hernández-Miranda, E. 2023. Genetic diversity and resilience in benthic marine populations. Revista Chilena de Historia Natural 96:4 https://doi.org/10.1186/s40693-023-00117-1 (WoS; Q2)
8. Hernandez-Miranda, E., Betancourt, I., Sobarzo, M., Vergara, O., Iturra, C., Quiñones, R.A. 2022. Spatial dissimilarity of zooplankton and hydrodynamic conditions in a Patagonian channel used intensely by aquaculture: the influence of a geomorphological constriction. Revista Chilena de Historia Natural 95(8):1-23. https://doi.org/10.1186/s40693‑022‑00111‑z . (WoS; Q2)
9. Zunguza, A., Montes, R.M., Cubillos, L.A., Quiñones, R.A. 2022. River runoff as a major driver of anchovy (Engraulis ringens) recruitment but not of common sardine (Strangomera bentincki)in Central-South Chile. Front. Mar. Sci. 9:800759.doi: 10.3389/fmars.2022.800759. (WoS; Q1)
10. Montes, R.M., Quiñones, R.A., Gallardo-Escarate, C. 2022. Disentangling the effect of sea temperature and stocking density on sea louse abundance using wavelets in a highly infested salmon farming area. Aquaculture 546, 737246. https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2021.737246. (WoS; Q1)
11. Franco-Meléndez, M., Cubillos, L.A., Tam, J., Hernández-Aguado, S., Quiñones, R.A., Hernández, A. 2021. Territorial Use Rights for Fisheries (TURF) in central-southern Chile: Their sustainability status from a transdisciplinary holistic approach. Marine Policy 132, 104644 DOI: 10.1016/j.marpol.2021.104644 (WoS; Q1)
12. Hernández, C., Quiñones, R.A. 2021. Las Fronteras del Milenio Prospección Biológica en Antártica y las Negociaciones para un Acuerdo Vinculante sobre la Diversidad Biológica en las Áreas Marinas más allá de la Jurisdicción Nacional. Revista Diplomacia 144. Chile y la Antártica: realidades y desafíos a futuro. https://bibliotecaacade.minrel.gov.cl/cgi-bin/koha/opac-retrieve-file.pl?id=5c94ca39835e3c1fa20133ef72d71f33 .
13. Soto, D., León-Muñoz, J., Garreaud, R., Quiñones, R.A., Morey, F. 2021. Scientific warnings could help to reduce farmed salmon mortality due to harmful algal blooms. Marine Policy 132, 104705. https://doi.org/10.1016/j.marpol.2021.104705 (WoS; Q1)
14. Hernández-Miranda, E., Veas, R., Krautz, M.C., Hidalgo, N., San Martín, F., Quiñones R.A. 2021. Efecto del tamaño de tamiz en la caracterización de la macrofauna marina bentónica: Implicancias para su uso en líneas de base, caracterizaciones preliminares de sitios para la acuicultura y monitoreos ambientales en Chile. Revista de Biología Marina y Oceanografía.  56 (1): 22-41. https://doi.org/10.22370/rbmo.2021.56.1.2796 (WoS; Q4)
15. Hernández-Miranda, E., Estrada, R., Strange, P., Veas, R., Krautz, M.C., Quiñones, R.A. 2021. Macrofauna community patterns in a Chiloe Island channel used intensely for aquaculture: the ecological status of its benthic environment. Revista Chilena de Historia Natural 94 (1). https://doi.org/10.1186/s40693-021-00098-z (WoS; Q2)
16. Hernández-Miranda, E., Veas, R., Krautz, M.C., Hidalgo, N., San Martín, F., Quiñones, R.A. 2021. Bioindicadores de contaminación marina costera y filtros de exclusión de organismos bentónicos y nectónicos en sistemas de captación de agua de mar. Páginas 269-288. En:  Castilla, J. C., Fariña, J. M., & Camaño, A. (Eds.). 2021. Programas de monitoreo del mediomarino costero: Diseños experimentales, muestreos, métodos de análisis y estadística asociada. Ediciones Universidad Católica. Santiago, Chile. 320 pp.
17. Krautz, M.C., Hernández-Miranda, E., Veas, R., Anabalón, V., Quiñones, R.A. 2021. Fito y zooplancton en programas de monitoreo costero: la necesidad de vincular su diversidad y abundancia con estimaciones de su estado vital. Páginas 289-316. En: Castilla, J. C., Fariña, J. M., & Camaño, A. (Eds.). 2021. Programas de monitoreo del medio marino costero: Diseños experimentales, muestreos, métodos de análisis y estadística asociada. Ediciones Universidad Católica. Santiago, Chile. 320 pp.
18. Hernández-Miranda E., y R. A. Quiñones. 2021. Propuesta metodológica para optimizar el uso de la macrofauna bentónica como bio-indicador en la evaluación de perturbaciones antropogénicas. Contribución a las Políticas Públicas N°10. Centro Interdisciplinario para la Investigación Acuícola (INCAR), FONDAP-ANID, Chile. 10 pp.  DOI: 10.13140/RG.2.2.17915.03361. https://centroincar.cl/wp-content/uploads/2021/11/PolicyBriefIncar10.pdf
19. Aedo, G., Garcés, C., Niklitschek, E., Musleh, S., Cubillos, L., Quiñones, R.A. 2020. Spatial distribution of small pelagic fishes: Implications for fishing quota allocations. Marine Policy 120, 104147. (ISI) https://doi.org/10.1016/j.marpol.2020.104147 (WoS; Q1)
20. Hernández, A., Tapia, F.J., Saldías, G.S., Quiñones, R.A. 2020. Coastal geomorphology and oceanographic features shape subtidal benthic communities in management areas of central Chile. Aquatic Conserv: Mar Freshw Ecosyst.1–13. https://doi.org/10.1002/aqc.3415 (WoS; Q1)
21. Garcés, D.V., Fuentes, M.E., Quiñones, R.A. 2020. Effect of Azamethiphos on enzymatic activity and metabolic fingerprints of marine microbial communities from the water column. Aquaculture. Volume 529, 735650. (ISI) https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2020.735650 (WoS; Q1)
22. Sepúlveda, M., Quiñones, R.A., Esparza, C., P. Carrasco, Winckler, P. 2020. Vulnerability of a top marine predator to coastal storms: a relationship between hydrodynamic drivers and stranding rates of newborn pinnipeds. Scientific Reports 10, 12807. https://doi.org/10.1038/s41598-020-69124-6 (WoS; Q1)
23. Cornejo, P., Guerrero, M., Montes, R.M., Quiñones, R.A., Sepúlveda, H.H. Hydrodynamic effect of biofouling infish cage aquaculture netting. Aquaculture 526, 735367. (ISI) https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2020.735367 (WoS; Q1)
24. Gutiérrez, M.H., Vera, J., Srain, B., Quiñones, R.A., Wörmer, L., Hinrichs, K-U. Pantoja-Gutiérrez, P. 2020. Biochemical fingerprints of marine fungi: implications for trophic and biogeochemical studies. Aquat. Microb. Ecol. 84:75-90. (WoS; Q1)
25. Labra, F.A., Hernández-Miranda, E., Quiñones, R.A. 2020. Assessing how body size affects the species-time relationship in a shallow marine benthic megafauna community exposed to a strong hypoxia disturbance. Mar Biol 167: 15-28 (ISI) (WoS; Q1)
26. Soto, D., León-Muñoz, J., Soria-Galvarro, Quiñones, R., Marin, S. 2020. Propuesta de evaluación del desempeño ambiental de la salmonicultura Chilena a escala de ecosistemas. Centro Interdisciplinario para la Investigación Acuícola (INCAR) y WWF Chile. Concepción Octuber 2020. 44 pp. https://www.incar.cl/wp-content/uploads/2021/01/Revista.pdf

 

 

Rodrigo González Saldías & Renato Quiñones Bergeret. 2012. Descripción: Dispositivo oceanográfico para el muestreo de la capa límite bentónica desde plataformas oceanográficas de pequeño tamaño hasta grandes buques. Instituto Nacional de Propiedad Industrial (INAPI) CL 762(2012). Fecha de Inicio de la Patente: 28-Marzo-2012;  Fecha de Fin de la Patente: 28-Marzo-2032.

Quiñones, R.A. 2024.  Conferencia invitada. Título: “Acuicultura Sustentable y Conservación de la Biodiversidad Marina en la Patagonia Chilena: El Desafío Científico”. La conferencia se dictó en el “I Seminario sobre la Protección de los Océanos y la Biodiversidad Marina”, organizado por la embajada de Chile en China. El evento se realizó en la Universidad de Geociencias de Beijing. 26 de septiembre,2024.

González M.-L., Soto D. Avendaño-Herrera R., Quiñones R. 2024. Response of marine planktonic microbial metabolism to florfenicol used in salmon farming:  a microcosm approach. Congreso Internacional “Gestión de enfermedades bacterianas en acuicultura: Una mirada interdisciplinaria”, Co-organizado por el Monterey Bay Aquarium (EEUU) y el Instituto Tecnológico del Salmón de SalmonChile (Intesal; Chile). 20-22 Noviembre 2024, Puerto Varas

González, M-L., Fariña, C. D., Quiñones, R. 2024. Efectos de un detergente usado en la salmonicultura sobre el metabolismo microbiano planctónico marino. XLIII versión del Congreso de Ciencias del Mar, Concepción, Chile.

González, M-L., Soto, D., Avendaño-Herrera, R., Quiñones R. 2024. Impacto del florfenicol sobre el metabolismo microbiano planctónico marino en un modelo de micrococosmos. 20º Congreso Latinoamericano de Ciencias del Mar – COLACMAR’2024. 13-16 de agosto de 2024, Itajaí, Brasil.

Quiñones, R.A. 2024.Conferencia invitada en el  Congreso “Por una mejor Universidad”. Titulo de la conferencia: “Construyendo interdisciplina en un centro de investigación aplicada de alta complejidad: el caso del INCAR”. Actividad organizada por el Departamento de Educación Médica, la Dirección de Docencia en Ingeniería y la Oficina de Educación Médico-Veterinaria de la Universidad de Concepción. Facultad de Medicina de la Universidad de Concepción, Concepción, Región del Biobío. 21 de marzo de 2024.

Quiñones, R.A. Montes, R., González, R. 2023. Pelagic Respiration and Biomass Size Spectra in the Humboldt Current System. Inaugural Science Symposium. Trevor Platt Science Foundation. August 7 – 11, 2023 Plymouth Marine Laboratory (PML), UK.  https://trevorfoundation.org/symposium-2023/#symposium

Quiñones, R.A. Cornejo, P., Montes, R.M. 2023. Expositor invitado. Nombre de la conferencia “Capacidad de carga ecológica de canales y fiordos patagónicos para el cultivo de salmón en Chile: enfoques, avances y desafíos”. InnAqua Conference. 26-28 septiembre, Puerto Varas.

Quiñones, R. A., Hernández-Miranda, E., Montes, R.M., Montecinos, L., Figueroa, N. 2022. Size spectra of benthic megafauna in a highly productive ecosystem of the Humboldt Current System: temporal and spatial variability in the Gulf of Arauco, Chile. Ocean Science Meeting. Co-sponsored by the American Geophysical Union (AGU), the Association for the Sciences of Limnology and Oceanography (ASLO), and The Oceanography Society (TOS).

Tapia, F., Sobarzo, M., Quiñones, R., Montes, R. 2022. Forzantes oceanográficas del varamiento de especies marinas en la costa de Chile central. XLI Congreso Ciencias del Mar, Concepción (Chile), 23-27 de mayo 2022.

González M. L., M. E. Fuentes, V. Molina y R.A. Quiñones.  2022. Respuesta microbiana a la Etoxiquina, un aditivo alimentario usado en la salmonicultura. XLI Congreso de Ciencias del Mar, Concepción, Chile.

Quiñones, R. A. 2022. Charla “On the Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR), Chile”. First member assembly of GSAAP online, 22 November 2022. Global Sustainable Aquaculture Advancement Partnership（GSAAP). Chinese Academy of Fishery Sciences (CAFS)

González M. L., M. E. Fuentes, S. Pantoja-Gutiérrez y R.A. Quiñones. 2022 “Biodisponibilidad de la materia orgánica disuelta derivada de la salmonicultura y su efecto en el metabolismo microbiano de la columna de agua”. XLI Congreso Ciencias del Mar, Concepción (Chile), 23-27 de mayo 2022.

Montes, R., Gallardo, C., Quiñones, R. 2022. Efectos de las densidades de cultivo de salmónidos y de la temperatura del agua sobre la abundancia de Caligus rogercresseyi”. XLI Congreso Ciencias del Mar, Concepción (Chile), 23-27 de mayo 2022.

Anabalon, V., Fuentes, M., Quiñones, R. 2022. Variabilidad espacial de las comunidades fitoplanctónicas en condiciones de postfloración en el Golfo de Penas y canales aledaños (Patagonia, Chile). XLI Congreso Ciencias del Mar, Concepción (Chile), 23-27 de mayo 2022.

Anabalon, V., Salamanca, M., Chandia, C., Rosemberg, L., Franyola, G.,  Quiñones R. 2022. Floración del género Scrippsiella en la costa Sur-Este del Golfo de Arauco: Composición taxonómica y posibles causas. XLI Congreso Ciencias del Mar, Concepción (Chile), 23-27 de mayo 2022.

Carrasco-Olivares, P., Vera, E., Quiñones, R. A. 2022. Gamificación y aprender haciendo, métodos de divulgación científica para una acuicultura sustentable. XLI Congreso Ciencias del Mar, Concepción (Chile), 23-27 de mayo 2022.

Krautz M. C., Veas R., Quiñones R.A. & Hernández-Miranda Eduardo. 2022.  Efecto de la variabilidad ambiental interanual en la dinámica espacio-temporal del ictioplancton en la plataforma continental de Chile Central. XLI Congreso de Ciencias del Mar. Universidad Católica de la Santísima Concepción. Chile, Concepción, 23-27 de Mayo de 2022.

Rojas-Canales, E., Lopez, C., Quiñones, R.A. 2022. Monitoreo oceanográfico participativo con pescadores artesanales como herramienta de gestión ambiental costera: el caso de Tarapacá. XLI Congreso de Ciencias del Mar, Concepción, Chile.

Quiñones, R.A. 2022. Expositor invitado. Título de la charla “Contribución de las ciencias del mar al desarrollo de la zona costera: conviviendo con la complejidad y la incerteza”. Seminario “La zona costera como polo para el desarrollo científico, productivo y social”. 31 de mayo de 2022. Ciclo de seminarios virtuales de la Red de Universidades Públicas agrupadas en el G9.

Quiñones, R.A. 2022. Conferencia invitada “Algunas reflexiones sobre investigación y desarrollo holístico de la acuicultura chilena”. Ciclo de charlas “Pongámonos al día: Academia y su aporte en la Acuicultura”, Club Innovación Acuícola, Puerto Varas (online). 6 de junio de 2022.

Quiñones, R.A. 2021. Charla inaugural del ciclo de charlas online “ConCiencia de Mar” de la Subsecretaría de Pesca y Acuicultura, Ministerio de Economía. Titulo de la Charla: “Conviviendo con la incertidumbre: papel de la ciencia en la administración sustentable de recursos marinos vivos”. 10 de mayo 2021.

Quiñones, R.A. 2021. Charla “Perspectivas sobre las necesidades de una Acuicultura Sustentable en Chile”. Taller “Avances y desafíos en las Ciencias del Mar en Chile frente a un océano cambiante”. Departamento de Oceanografía, Universidad de Concepción.

Vásquez C., Vera, I., Hernández-Miranda, E., Brante, A., Quiñones, R. 2021. Mega perturbaciones naturales como modeladores de la estructura espacial y temporal de la diversidad genética de Aphos porosus. 1er Congreso Latinoamericano de Evolución. CLOVECOL. Modalidad Virtual. 30 Noviembre – 03 de Diciembre de 2021.

Quiñones, R.A. 2020. Conferencia invitada. “La investigación interdisciplinaria como elemento crucial del enfoque ecosistémico en la acuicultura”. Seminario Internacional “Manejo de recursos acuáticos con enfoque ecosistémico: avances, brechas y colaboración”. Organizado por la Sociedad Chilena de Ciencias del Mar y el Instituto de Fomento Pesquero. 1-3 de diciembre de 2020. Online

Quiñones, R.A. 2020.Conferencia invitada. Título de la conferencia “La investigación interdisciplinaria como elemento crucial del enfoque ecosistémico en la acuicultura”. Seminario Internacional “Manejo de recursos acuáticos con enfoque ecosistémico: avances, brechas y colaboración”. Organizado por la Sociedad Chilena de Ciencias del Mar y el Instituto de Fomento Pesquero. 1-3 de diciembre de 2020. Online.